Tussen de alters onderling kan een gehele of gedeeltelijke subjectieve amnesie bestaan; de mate waarin de verschillende alters van elkaar op de hoogte zijn, varieert.
De onderzoekers veronderstellen dat er bij DIS formeel geen amnesie optreedt, maar dat patienten de overtuiging hebben dat ze in de ene toestand niet kunnen weten wat ze in de andere meemaken. Er zou eerder sprake zijn van een cognitieve vertekening dan van (formele) amnesie. Het ophalen van herinneringen zou wel intact intact zijn, maar ze zouden op sommige momenten geen gebruik maken van de opgehaalde infomatie. Het gaat dus om functionele amnesie.