Noem 5 stappen die je kunt zetten in data quality control (transcriptomics).

• visual inspection of the arrays (kan alleen bij microarrays): originele afbeeldingen controleren op stains/artefacten
• box plots (verdeling)
• histogram/density plots: frequentieverdeling expression values alle genen. maken van log2 ratio's 
• scatter plots/MA plots: expresie van gen in ene situatie op x, in andere situatie op y. Als veel verschilt: ver van diagonaal. je werkt met log FC
• PCA:  pak PC1 en PC2 om meeste dynamiek in data te behouden en dimensies tot 2 te brengen ipv 20000. checken of er gekke dingen gebeuren/groepering tussen samples/variabelen