Noem 2 verschillen tussen de manier waarop RNA polymerase (bacterieel) en RNA polymerase II (eukaryoot) functioneren.
bacterieel RNA polymerase heeft maar 1 trancriptie-initiatie factor nodig, namelijk de sigma factor. eukaryotic RNA polymerase heeft er meerdere nodig, samen de general transcription factors genoemd.
eukaryotische transcriptie vindt plaats op DNA dat verplakt is in nucleosomen, en hogere orde vormen van chromatine structuren. Dit is niet het geval voor bacterieel DNA.