Gemeenteraad kan BP ten opzichte van ontwerp gewijzigd vaststellen. Wijzigingen hoeven niet per se samen te hangen met naar voren gebrachte zienswijzen, maar kunnen ook ambtshalve worden aangebracht. Wanneer wijzigingen ingrijpend zijn, kan raadzaam zijn nieuwe procedure te starten, omdat onderzoeks- en overlegresultaten niet langer voldoende onderbouwing van plan vormen. Om welke reden ook het plan gewijzigd ten opzichte van ontwerp wordt vastgesteld, motivering daarvoor moet bij raadsbesluit worden gegeven. Gelijke verplichting rust op gemeenteraad wanneer naar voren gebrachte zienswijzen tegen ontwerp niet worden gehonoreerd art. 3:46 Awb.